0.13.0
Installation
API
Single Cell
H5AD Map
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap
H5ADMap
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.chunk_X
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.chunked_X
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.concatenate
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.copy
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.diet_subset
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.flush
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.free_temp_processing
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obs_keys
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obs_names_make_unique
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obs_vector
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obsm_keys
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.rename_categories
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.set_backed
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.strings_to_categoricals
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.to_df
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.to_memory
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.transpose
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.uns_keys
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.var_keys
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.var_names_make_unique
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.var_vector
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.varm_keys
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.write
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.write_csvs
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.write_h5ad
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.write_loom
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.write_zarr
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.T
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.X
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.file
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.filemode
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.filename
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.is_view
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.isbacked
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.layers
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.n_obs
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.n_vars
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obs
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obs_names
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obsm
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.obsp
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.raw
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.shape
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.uns
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.var
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.var_names
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.varm
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.varp
bioalpha.h5ad_map.SparseDatasetMap
bioalpha.h5ad_map.BatchReader
bioalpha.h5ad_map.H5ADLoader
bioalpha.h5ad_map.batch_settings
Tutorial
Bioalpha
API
H5AD Map
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.shape
bioalpha.h5ad_map.H5ADMap.shape
property
H5ADMap.
shape
:
Tuple
[
int
,
int
]
Shape of data matrix (
n_obs
,
n_vars
).